鹰潭市生态环境局在原鹰潭市环境保护局原有职能的基础上，增加应对气候变化和减排、监督防止地下水污染、编制水功能区划、排污口设置管理、流域水环境保护、监督指导农业面源污染治理等职责，统一行使生态和城乡各类污染排放监管与行政执法职责。同时，县级生态环境部门还将收归鹰潭市生态环境部门，作为市局的派出机构。